大雄在后山发现了一棵发着微光的神秘树苗，他将其取名为“绿宝”。在哆啦A梦的道具帮助下，绿宝一夜之间长成了参天大树，并且整座城市都开始疯狂生长出各种奇异植物。起初人们欢呼这是环保的胜利，但植物们很快开始攻击建筑物和人类，仿佛有了意识。大雄等人利用道具进入植物的集体意识空间，发现绿宝其实是外星文明投放的“星球改造种子”，目的是将地球改造成适合它们种族居住的植物星球。而唤醒绿宝的，正是大雄纯粹的善意。为了拯救地球，大雄必须亲手切断与绿宝的精神连接，这意味着他要杀死自己的“朋友”。
经典IP的又一次大胆革新，画风唯美，想象力惊人。故事内核探讨了善意的边界和文明冲突的无奈。大雄最后的选择极其虐心，延续了《哆啦A梦》剧场版一贯的深刻与感人。环保主题不空洞，而是融入了扎心的剧情中。
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